Protein–RNA interactions for Protein: Q86WV1

SKAP1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP1Q86WV1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SKAP1Q86WV1 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms