Protein–RNA interactions for Protein: Q86UW6

N4BP2, NEDD4-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
N4BP2Q86UW6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
N4BP2Q86UW6 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
N4BP2Q86UW6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms