Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PTF1AQ7RTS3 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PTF1AQ7RTS3 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms