Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
BRINP3Q76B58 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BRINP3Q76B58 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms