Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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USP34Q70CQ2 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP34Q70CQ2 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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