Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2E9

EDC4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDC4Q6P2E9 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EDC4Q6P2E9 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms