Protein–RNA interactions for Protein: Q6NT76

HMBOX1, Homeobox-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMBOX1Q6NT76 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
HMBOX1Q6NT76 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.3 ms