Protein–RNA interactions for Protein: Q6IC98

GRAMD4, GRAM domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD4Q6IC98 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
GRAMD4Q6IC98 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
GRAMD4Q6IC98 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53 ms