Protein–RNA interactions for Protein: Q5UIP0

RIF1, Telomere-associated protein RIF1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIF1Q5UIP0 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
RIF1Q5UIP0 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 AC079776.1-201ENST00000401540 1152 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
RIF1Q5UIP0 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms