Protein–RNA interactions for Protein: Q59GN2

RPL39P5, Putative 60S ribosomal protein L39-like 5, humanhuman

Predictions only

Length 51 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P5Q59GN2 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
RPL39P5Q59GN2 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
RPL39P5Q59GN2 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms