Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
TDRD12Q587J7 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms