Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CCDC93Q567U6 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms