Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CDCA8Q53HL2 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms