Protein–RNA interactions for Protein: Q502W7

CCDC38, Coiled-coil domain-containing protein 38, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC38Q502W7 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AC010947.1-201ENST00000623454 693 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
CCDC38Q502W7 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms