Protein–RNA interactions for Protein: Q3B726

TWISTNB, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA43, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWISTNBQ3B726 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TWISTNBQ3B726 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TWISTNBQ3B726 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms