Protein–RNA interactions for Protein: Q2VYF4

LETM2, LETM1 domain-containing protein LETM2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETM2Q2VYF4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LETM2Q2VYF4 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETM2Q2VYF4 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LETM2Q2VYF4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
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