Protein–RNA interactions for Protein: Q2M389

WASHC4, WASH complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC4Q2M389 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
WASHC4Q2M389 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
WASHC4Q2M389 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms