Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CSPP1Q1MSJ5 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CSPP1Q1MSJ5 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
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