Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COL24A1Q17RW2 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COL24A1Q17RW2 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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