Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GEN1Q17RS7 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
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GEN1Q17RS7 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GEN1Q17RS7 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
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GEN1Q17RS7 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
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GEN1Q17RS7 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
GEN1Q17RS7 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
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