Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
CDO1Q16878 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CDO1Q16878 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
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CDO1Q16878 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CLN3-259ENST00000637551 1083 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDO1Q16878 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
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