Protein–RNA interactions for Protein: Q16828

DUSP6, Dual specificity protein phosphatase 6, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP6Q16828 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
DUSP6Q16828 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
DUSP6Q16828 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms