Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC098483.1-202ENST00000436515 967 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AL137078.1-201ENST00000446280 404 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AL133368.2-201ENST00000556978 386 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LINC01198-206ENST00000595532 1125 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
FOXD1Q16676 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC26.58■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 RFC3P1-201ENST00000454568 682 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KATNBL1P4-201ENST00000503545 918 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC114284.1-201ENST00000511422 1114 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AL109924.4-201ENST00000623089 670 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 OR14A16-202ENST00000641093 1367 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AL353681.1-201ENST00000435828 731 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ZSWIM7-209ENST00000486655 726 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 USP9YP2-201ENST00000504503 1000 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 MEF2C-AS1-206ENST00000511100 828 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 USP9YP1-201ENST00000513521 1002 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC018362.2-202ENST00000567089 562 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AL359641.1-201ENST00000412509 1558 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PRR16-203ENST00000446965 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FOXD1Q16676 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
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