Protein–RNA interactions for Protein: Q16654

PDK4, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 4, mitochondrial, humanhuman

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK4Q16654 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TOX2-205ENST00000423191 1709 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PDK4Q16654 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
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