Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SYPL1Q16563 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
SYPL1Q16563 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms