Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AL031985.4-201ENST00000642138 673 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
ATP6AP1Q15904 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ATP6AP1Q15904 TMEM240-201ENST00000378733 718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
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