Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ASPG-206ENST00000551177 4851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MBD1-212ENST00000585672 2532 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ANO6-202ENST00000423947 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RIC1-201ENST00000251879 4127 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM171B-201ENST00000304698 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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VAMP3Q15836 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SPPL2A-201ENST00000261854 7372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
VAMP3Q15836 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.36
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