Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
CCDC85BQ15834 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms