Protein–RNA interactions for Protein: Q15651

HMGN3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGN3Q15651 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
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HMGN3Q15651 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HMGN3Q15651 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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