Protein–RNA interactions for Protein: Q15021

NCAPD2, Condensin complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,401 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD2Q15021 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NCAPD2Q15021 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NCAPD2Q15021 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
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