Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AKR1B10P2-201ENST00000577332 927 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
LAPTM4AQ15012 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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