Protein–RNA interactions for Protein: Q15008

PSMD6, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD6Q15008 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
PSMD6Q15008 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
PSMD6Q15008 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
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