Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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GPNMBQ14956 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPNMBQ14956 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
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