Protein–RNA interactions for Protein: Q14623

IHH, Indian hedgehog protein, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IHHQ14623 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
IHHQ14623 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
IHHQ14623 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
IHHQ14623 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
IHHQ14623 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms