Protein–RNA interactions for Protein: Q14264

ERV3-1, Endogenous retrovirus group 3 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERV3-1Q14264 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
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ERV3-1Q14264 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
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ERV3-1Q14264 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
ERV3-1Q14264 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms