Protein–RNA interactions for Protein: Q14139

UBE4A, Ubiquitin conjugation factor E4 A, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE4AQ14139 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBE4AQ14139 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
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UBE4AQ14139 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
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