Protein–RNA interactions for Protein: Q13868

EXOSC2, Exosome complex component RRP4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 293 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC2Q13868 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EXOSC2Q13868 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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