Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.4■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
DDX39BQ13838 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
DDX39BQ13838 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
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