Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PARP8-218ENST00000513738 596 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
SPTAN1Q13813 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
SPTAN1Q13813 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
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