Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL121820.2-201ENST00000556301 279 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
RUNX3Q13761 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
RUNX3Q13761 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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