Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PEX6Q13608 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PEX6Q13608 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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