Protein–RNA interactions for Protein: Q13401

PMS2P3, Putative postmeiotic segregation increased 2-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P3Q13401 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
PMS2P3Q13401 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PMS2P3Q13401 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
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