Protein–RNA interactions for Protein: Q13232

NME3, Nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3Q13232 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
NME3Q13232 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
NME3Q13232 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
NME3Q13232 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
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