Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
RPA4Q13156 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
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