Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CHAF1AQ13111 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CHAF1AQ13111 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
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