Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TRDNQ13061 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TRDNQ13061 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TRDNQ13061 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TRDNQ13061 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
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