Protein–RNA interactions for Protein: Q13042

CDC16, Cell division cycle protein 16 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC16Q13042 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
CDC16Q13042 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms