Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRAF2Q12933 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms