Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TROQ12816 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TROQ12816 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
TROQ12816 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TROQ12816 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TROQ12816 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TROQ12816 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
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