Protein–RNA interactions for Protein: Q12792

TWF1, Twinfilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TWF1Q12792 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TWF1Q12792 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms